O LEPAN conta com seis espaços.

Acervo Arqueológico: Povos Originários: Destinado ao acondicionamento e conservação de materiais arqueológicos não-orgânicos provenientes de contextos culturais de povos originários sul-americanos (ex: lítico, cerâmica).

Acervo Arqueológico: Materiais orgânicos: Destinado ao acondicionamento e conservação de materiais arqueológicos orgânicos provenientes de quaisquer contextos, tais como remanescentes humanos e artefatos ou remanescentes de ossos, conchas, madeiras e fibras.

Acervo Arqueológico: Colonial e Pós-Colonial: Destinado ao acondicionamento e conservação de materiais arqueológicos não-orgânicos provenientes de contextos culturais do período colonial e republicano brasileiro (metais, vidros, cerâmicas, faianças, porcelanas, plásticos etc.)

Escritório e Acervo Documental: Destinado à organização da documentação relacionada às coleções acervadas na RTA.

Laboratório Molhado: Local destinado à limpeza molhada das coleções acondicionadas na RTA.

Sala Expositiva: Destinada a exposição de materiais arqueológicos e recebimento de visitantes, realização de aulas para turmas com até 10 alunos, e recebimento de pesquisadores interessados em analisar materiais do nosso acervo.